SMK Terpadu YAPISA Megamendung didirikan atas dasar kepedulian terhadap pentingnya pendidikan vokasi yang berbasis keterampilan dan akhlak mulia di wilayah Megamendung, Kabupaten Bogor. Sekolah ini berdiri sebagai bentuk kontribusi Yayasan Pendidikan Islam Terpadu Sa’id Abdurochman (YAPISA) dalam mencetak generasi muda yang tidak hanya unggul dalam ilmu pengetahuan, tetapi juga istiqomah dalam beribadah serta berakhlakul karimah. Pada Awalnya, tujuan utama pendirian sekolah ini adalah untuk memberikan pendidikan kejuruan berkualitas bagi masyarakat sekitar, khususnya bagi para pelajar yang ingin langsung siap kerja maupun melanjutkan pendidikan ke jenjang yang lebih tinggi.
SMK Terpadu YAPISA resmi didirikan pada tanggal 30 Januari 2009, berdasarkan SK Pendirian Sekolah Nomor 421/283-disdik, yang sekaligus menjadi tanggal diterbitkannya Izin Operasional Sekolah dengan nomor yang sama. Sekolah ini berstatus swasta dan berada di bawah naungan Yayasan Pendidikan Islam Terpadu Sa’id Abdurochman (YAPISA) yang memiliki komitmen kuat dalam membangun pendidikan Islam yang terpadu dengan ilmu pengetahuan dan teknologi. Para pendiri sekolah ini adalah tokoh-tokoh pendidikan dan masyarakat yang peduli terhadap kemajuan generasi muda, yang digerakkan oleh semangat untuk memberikan alternatif pendidikan terbaik di kawasan Puncak, Bogor. Adapun para pendiri sekolah ini diantaranya:
- Abdul Hamid, S, Ag., M. Pd.
- Bunyamin, S. Pd. I., M. Pd.
- Enda Prameswara, S. Pd.
- Dadang Permana, S. Pd.
- Pudoli, S. Pd. I.
Pada awal berdirinya, kegiatan belajar mengajar dilaksanakan di gedung sederhana milik MTs Terpadu Yapisa yang berlokasi di Jalan Raya Cikopo Selatan KM. 06, Desa Sukaresmi, Kecamatan Megamendung, Kabupaten Bogor, Jawa Barat. Seiring bertambahnya jumlah siswa dan meningkatnya kebutuhan fasilitas pendidikan, sekolah kemudian pindah ke gedung baru yang lebih representatif di lokasi yang masih berada di kawasan MTs Terpadu Yapisa, dengan fasilitas yang lebih lengkap dan memadai.
Saat pertama kali dibuka, SMK Terpadu YAPISA hanya memiliki satu program keahlian, yaitu Akuntansi. Namun, seiring dengan perkembangan zaman dan kebutuhan dunia industri yang semakin kompleks, sekolah ini terus melakukan inovasi dengan menambahkan beberapa jurusan baru. Penambahan jurusan dilakukan secara bertahap sebagai bentuk respons terhadap minat siswa dan tuntutan pasar kerja. Pada tahun 2014, SMK Terpadu YAPISA telah membuka satu program keahlian yang baru, yaitu Otomatisasi dan Tata Kelola Perkantoran (OTKP) dan pada tahun 2016, menambah satu program keahlian yang baru, yaitu Multimedia.
Dengan semangat “Unggul dalam Ilmu, Istiqomah dalam Ibadah, Berakhlakul Karimah dan Berwawasan Global”, SMK Terpadu YAPISA Megamendung terus berkembang menjadi lembaga pendidikan kejuruan yang tidak hanya mencetak lulusan siap kerja, tetapi juga mencetak generasi yang memiliki karakter kuat dan berdaya saing tinggi di era globalisasi.